新方法鑒定到可預(yù)測(cè)癌癥發(fā)展的基因
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當(dāng)研究人員用SAPS對(duì)之前已經(jīng)在乳腺及卵巢中鑒定到的預(yù)后特征進(jìn)行分析時(shí)發(fā)現(xiàn),只有少數(shù)的特征經(jīng)SAPS評(píng)估后仍具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義.“我們的工作表明,當(dāng)使用預(yù)后關(guān)聯(lián)來(lái)鑒定癌癥發(fā)展的生物特征時(shí),不能單單依賴(lài)于那些只與病人生存有關(guān)的基因集.”Beck說(shuō).“一個(gè)基因集與生存的相關(guān)性似乎十分重要,但事實(shí)上,它的表現(xiàn)并沒(méi)有明顯優(yōu)于隨機(jī)基因.這是一個(gè)嚴(yán)重的問(wèn)題,因?yàn)檫@可以導(dǎo)致錯(cuò)誤結(jié)論的產(chǎn)生.”Beck及其同事通過(guò)SAPS,發(fā)現(xiàn)他們可以克服這一困難.“SAPS程序可以確保一個(gè)重要的預(yù)后基因集不僅與患者存活期有關(guān)聯(lián),而且所起的作用要顯著優(yōu)于隨機(jī)基因的.”Beck說(shuō).他的研究小組在乳腺癌及卵巢癌亞型中發(fā)現(xiàn)了新的預(yù)后特征,而且證明了雌激素受體陰性乳腺癌與卵巢癌兩者的預(yù)后特征具有驚人的相似性,暗示著這些惡性腫瘤擁有相同的治療靶標(biāo).
這些發(fā)現(xiàn)同樣暗示著SAPS所鑒定到的預(yù)后特征不僅能幫助病人預(yù)測(cè)病情發(fā)展,還有助于新抗癌藥物的開(kāi)發(fā).“希望我們所鑒定到的標(biāo)記能幫助我們更深入地了解乳腺癌及卵巢癌亞型癌癥發(fā)展的生物通路,將來(lái)有一天可以幫助我們改良有針對(duì)性的診斷及治療方法.”Beck說(shuō),“我們希望這個(gè)方法能為其他研究人員提供廣泛的應(yīng)用價(jià)值.”為了實(shí)現(xiàn)這一目的,研究小組創(chuàng)建了一個(gè)網(wǎng)絡(luò)訪問(wèn)工具,讓那些對(duì)統(tǒng)計(jì)軟件及程序不太熟悉的研究人員能在其它疾病中鑒定到與疾病發(fā)展相關(guān)的基因集.“我們還計(jì)劃不久后就釋放這個(gè)軟件包,里面包含了所有的代碼及與分析相關(guān)的文檔.”Haibe-Kains補(bǔ)充說(shuō),“這樣,其他人就可以重復(fù)我們的結(jié)果,從而使生物信息學(xué)及計(jì)算生物學(xué)團(tuán)體能夠?qū)ξ覀兊姆治龇椒ㄟM(jìn)行接收及改良,以此來(lái)解決生物醫(yī)學(xué)上所遇到的新問(wèn)題.”